O padroado da Fundación é o órgano superior de gobierno. Os seus membros representan as seguintes entidades públicas e privadas:

Deputación da Coruña
http://www.dicoruna.es

Concello de As Pontes
http://www.aspontes.org

Concello de Cerceda
http://www.cerceda.es

Instituto Enerxético de Galicia (INEGA)
http://www.inega.es

Sociedade Galega do Medio Ambiente, S.A. (SOGAMA)
http://www.sogama.es

Caixanova
http://www.caixanova.es

Caixa Galicia
http://www.caixagalicia.es

Endesa
http://www.endesa.es/
Alarde Sociedad de Energía, S.A.

Fundación para a Orientación Profesional, Emprego e Formación en Galicia (Forga)
http://www.forga.org
Son patronos eleitivos, designados polos anteriores:

Dirección Xeral de Industria, Enerxía e Minas da Consellería de Innovación e Industria da Xunta de Galicia
http://www.conselleriaiei.com

Universidade da Coruña
http://www.udc.es

Universidade de Santiago de Compostela
http://www.usc.es

Unión de Consumidores de Galicia
http://www.ucgal.org
A fundacion contará con dous órganos complementarios: o Comité Científico e o Comité de Supervisión. As súas tarefas son de apoio e asesoramento ao padroado.
O Presidente da FAEPAC é D. Jesús Salvador Fernandez Moreda, na función de Presidente da Deputación da Coruña.
O Vicepresidente da FAEPAC é D. Pablo Villamar Díaz, na súa función de Presidente da Comisión de Promoción Económica da Deputacion da Coruña.
O cadro de persoal co que conta a Axencia para desenvolver as suas actividades está formado por:
Dirección:
D. Jesús Castro Lozano
Administración:
Dna. Eva Rios Silveira.
Departamento Técnico:
D. Jose Manuel Golpe Acuña (Técnico en Enerxías Renovábeis).
Dna. Mª Rosario Méndez Gil (Técnico de Planificación Enerxética).