El patronato de la Fundación es el órgano superior de gobierno. Sus miembros representan a las siguientes entidades públicas y privadas:

Deputación da Coruña
http://www.dicoruna.es

Concello de As Pontes
http://www.aspontes.org

Concello de Cerceda
http://www.cerceda.es

Instituto Enerxético de Galicia (INEGA)
http://www.inega.es

Sociedade Galega do Medio Ambiente, S.A. (SOGAMA)
http://www.sogama.es

Caixanova
http://www.caixanova.es

Caixa Galicia
http://www.caixagalicia.es

Endesa
http://www.endesa.es/
Alarde Sociedad de Energía, S.A.

Fundación para a Orientación Profesional, Emprego e Formación en Galicia (Forga)
http://www.forga.org
Son patronos electivos, designados por los anteriores:

Dirección Xeral de Industria, Enerxía e Minas da Consellería de Innovación e Industria da Xunta de Galicia
http://www.conselleriaiei.com

Universidade da Coruña
http://www.udc.es

Universidade de Santiago de Compostela
http://www.usc.es

Unión de Consumidores de Galicia
http://www.ucgal.org
La fundacion contará con dos órganos complementarios: el Comité Científico y el Comité de Supervisión. Sus tareas son de apoyo y asesoramiento al patronato.
El Presidente de FAEPAC es D. Jesús Salvador Fernandez Moreda, en la función de Presidente de la Deputación da Coruña.
El Vicepresidente de FAEPAC es D. Pablo Villamar Díaz, en su función de Presidente de la Comisión de Promoción Económica de la Deputacion da Coruña.
El cuadro de personal con que cuenta la Agencia para desarrollar sus actividades está formado por:
Dirección:
D. Jesús Castro Lozano
Administración:
Dña. Eva Rios Silveira.
Departamento Técnico:
D. Jose Manuel Golpe Acuña (Técnico en Energías Renovables).
Dña. Mª Rosario Méndez Gil (Técnico de Planificación Energética).